Η Δ.Ε.Π.Θ.Ε. διοικείται από ενδεκαμελές Διοικητικό Συμβούλιο, τα μέλη του οποίου – καθώς και ο/η Πρόεδρος και Αντιπρόεδρος – ορίζονται από το Δημοτικό Συμβούλιο του Δήμου Θεσσαλονίκης. Σύμφωνα με τις διατάξεις της παρ. 2γ. του άρθρου 3 του ΠΔ/τος 25/15-1-1988, από τα μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου της Δ.Ε.Π.Θ.Ε., πέντε (5) είναι αιρετοί εκπρόσωποι του Δήμου Θεσσαλονίκης, ένα (1) είναι εκπρόσωπος της ΕΣΗΕΜ-Θ και ένα (1) είναι εκπρόσωπος των εργαζομένων, ενώ α υπόλοιπα τέσσερα (4) μέλη είναι δημότες ή κάτοικοι του Δήμου Θεσσαλονίκης με πείρα ή γνώσεις σχετικές με το αντικείμενο της επιχείρησης.

Το Δ.Σ. συνεδριάζει κατά μέσο όρο δύο (2) φορές το μήνα και χρέη γραμματέως εκτελεί η Χριστίνα Φράγκου.

ΠΡΟΕΔΡΟΣ

Βεϊζαδές Απόστολος 

ΑΝΤΙΠΡΟΕΔΡΟΣ

Κούπκας Μιχάλης Δημοτικός Σύμβουλος

ΜΕΛΗ

Γάκης Βασίλειος Δημοτικός Σύμβουλος

Ζεϊμπέκης Νικόλαος Δημοτικός Σύμβουλος

Διαμαντάκης Βασίλειος Λαϊκό μέλος

Νικηφόρος Δημήτριος Λαϊκό μέλος